如何用disgenet数据库查询疾病靶点
1、步骤1：访问DisGeNET数据库官网。要查询疾病靶点，首先需要打开DisGeNET的官方网站。步骤2：在搜索框中输入疾病名称或相关术语。在网站的搜索栏中，您可以输入您想要查询的疾病名称或其相关术语。例如，如果您想查询癌症的靶点，可以输入cancer或者相关的症状、表现等关键词。
2、要高效使用DisGeNET数据库，建议首先注册并登录其官方网站。在登录后，用户可直接在搜索框输入感兴趣的基因或疾病名称，系统将返回相关联的信息列表。此列表包含多个维度的数据，如基因突变与疾病之间的关联强度、文献引用数量、突变频率等，帮助研究者快速筛选出最有价值的信息。
3、在特定检索结果页面，比如针对阿尔兹海默症的检索，显示了数据库中与该疾病相关的所有基因（共计5044个）。用户可以通过特定指标对基因进行筛选，以评估其与阿尔兹海默病的关系重要性。点击任意一个基因，可以查看与阿尔兹海默症相关的所有证据、出版文献以及Disgenet的关联本体。
4、在swisstargetprediction数据库预测活性成分靶点后，设置score值进行靶点筛选，然后与疾病靶点集合进行交集运算。注意，各成分对应的靶点文件无需去重，之后构建网络图时使用。成分若无pubchemcid，需通过swissadme评估其类药性，判断是否为有效化合物，不宜直接删除。
5、具体操作中，利用TCMSP数据库等筛选药物有效成分和靶标，GeneCards数据库和DisGeNET数据库检索疾病相关靶点，Venny工具构建药物靶点与疾病靶点的交集网络，String数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络，DAVID数据库进行GO和KEGG分析，最后使用Cytoscape等软件进行网络可视化。
6、生物信息学工具助力探索DISGENET plus的Web界面不仅支持单个疾病、基因或变异的搜索，还能通过列表进行多维度探索。强大的搜索结果呈现包括GDA和VDA的摘要、证据支持以及可视化图形，如网络图和热图。REST API和disgenet2r软件包的更新，使用户能够直接与平台数据交互，进行深入的分析和可视化。
人类疾病数据库MalaCards
MalaCards为每个疾病-基因关联关系分配了一个相关分，结合八个数据库的得分进行加权计算。数据库定义了“精英”基因，这些基因是人工注释和可靠资源识别的与特定疾病关联的关键基因。MalaCards提供了一个丰富的人类疾病信息资源，为研究者、临床医生和公众提供了深入理解疾病的基础。
MalaCards是一个可搜索的集成型数据库，提供了关于所有已注释的人类疾病的全面而易于使用的信息。这个知识库自动地从75个选择的网络资源整合以疾病为中心的数据，它的架构和丰富性参考了人气很高的GeneCards人类基因数据库。
基因信息的查询主要依赖于三大数据库：GeneCards、BioGPS和UCSC Genome Browser。GeneCards提供全面的人类基因信息，整合了约150个在线基因中心数据，包括基因组、转录子、别名、结构域、药物、表达和定位等信息。BioGPS是一个自由拓展和定制的基因注释网站，主要包含人类、小鼠和大鼠的基因。
疾病相关基因数据库?
DisGeNET数据库，一个与疾病相关的基因数据库，旨在汇集和整合基因与疾病之间的关联信息，为研究者提供一个全面的资源平台。使用DisGeNET数据库，研究者可通过搜索特定的基因或疾病名称，获取详细的关联信息，包括文献引用、突变频率、功能注释等。要高效使用DisGeNET数据库，建议首先注册并登录其官方网站。
Disgenet数据库，一个专为研究复杂疾病和罕见病的平台，已经完成了整合，合并了DisGeNET.org和DISGENET plus，成为了统一的Disgenet.com平台。
疾病数据库如HGMD、OMIM、ClinVar、InterVar和ClinGen数据库，提供病患变异的致病性评估。HGMD数据库包含突变标签，OMIM数据库提供疾病信息，ClinVar数据库整合遗传变异、临床表型、支持证据和功能注解。InterVar和ClinGen数据库则分别提供自动化评分和基因组区域、基因和变异评审筛选结果。
遗传病领域的重要资源之一是ClinGen数据库，它提供了一个关于基因与疾病关系的综合平台。在该数据库中，遗传病主要分为两类：单倍剂量不足（HI）和三倍剂量敏感（TS）。
率先体验:Disgenet复杂疾病/罕见病数据库
1、Disgenet数据库，一个专为研究复杂疾病和罕见病的平台，已经完成了整合，合并了DisGeNET.org和DISGENET plus，成为了统一的Disgenet.com平台。
2、MalaCards的疾病卡涵盖了罕见疾病、遗传病、复杂疾病等，每种疾病包含的基因数量多于OMIM，少于DisGeNET。数据库提供直接搜索疾病卡和搜索卡中部分内容的两种方法。
全网疾病单细胞数据库汇总
SCXA：收录了各种疾病类型的单细胞数据，持续更新。网址：ebi.ac.uk/gxa/sc/home Single Cell Portal：收录了1800万+的单细胞数据库，持续更新。网址：singlecell.broadinstitute.org... SCPortalen：收录了大量的单细胞测序数据。
包含638个study中的4000万种细胞，覆盖107个组织、细胞系或类器官、158种疾病和20个平台，用于细胞和细胞子集的聚集分析，提供基因表达的可视化，以及在线工具支持单细胞RNA-seq数据的集成、注释和投影。
Cell Marker数据库汇集了细胞标志物信息，支持用户查询特定基因与细胞状态的关系。Cell Blast、PanglaoDB、SC2disease、Jingle Bells和TISCH等数据库则提供了更具体的细胞类型鉴定、注释和比较服务，涵盖了动物细胞图谱、单细胞转录组分析、疾病相关基因比较、免疫细胞研究以及肿瘤微环境分析等多个方面。
HCA Human Cell Atlas：人类细胞图谱计划，包含大规模、全面的单细胞数据，关注人正常组织，提供数据下载与分析。 HCL Human Cell Landscape：人类细胞图谱研究成果，包含702，968个单细胞数据，覆盖102种细胞大类和843种细胞亚类，支持细胞类型鉴定。
分析单细胞数据时，常感疑惑，希求参考他人研究成果。单细胞数据库汇总如下，助力减轻文献查阅负担：数据库1：PanglaoDB，物种限定，组织类型众多。检索10X小鼠肺脏rawdata，步骤简洁：点击sample，选择物种、协议，找到Lung，点击SRA序列号。
Lancet主刊重磅!未被挖掘又好用的数据库,竟然能上柳叶刀!这个GBD数据...
全球疾病负担数据库（GBD）是一个综合性的、国际性的疾病和健康情况数据库，由全球疾病负担合作组织维护和更新。重要的是，该数据库向全球用户开放，无需注册或付费，只需在搜索框中选择所需数据并进行搜索即可下载。
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我是发展号的签约作者“天梅”！
希望本篇文章《疾病库疾病库 药品目录 诊疗目录》能对你有所帮助！
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